+7 (800) 700-19-29 Звонок по России бесплатный Пн-Вск 8:00-21:00 по Москве
+7 (800) 700-19-29

Вопросы · Ситуационные задачи · Тренировка

Генетика - кейс 7

Прочитайте условие и отметьте все подходящие варианты в каждом вопросе.

Условие задачи

Justification
Justification

УСЛОВИЕ СИТУАЦИОННОЙ ЗАДАЧИ

Ситуация

Супружеская пара обратилась к врачу-генетику с целью уточнения прогноза потомства в настоящем браке. Также супруги хотят уточнить целесообразность и возможности преимплантационного генетического тестирования в протоколе ЭКО.

Жалобы

На отсутствие беременности в течение 4 лет.

Анамнез заболевания

У мужчины брак второй. В первом браке был ребенок, мальчик с болезнью Верднига-Гоффмана (умер в возрасте 1 года). Со слов мужчины, диагноз был установлен клинически и подтвержден молекулярно-генетическими методами. Родителей не обследовали. Выписки не сохранились. В настоящем браке в течение 4 лет физиологических беременностей не было.

Анамнез жизни

Женщине (супруге) – 38 лет, мужчине (супругу) 43 года. В кровном родстве не состоят. В браке более 4 лет, детей нет. Профессиональных вредностей нет. Вредных привычек не имеют. Хронические заболевания отрицают.

Объективный статус

На приеме супружеская пара, фенотипических особенностей не выявлено. В настоящем браке беременность самостоятельно не наступала в течение 4 лет. Супружеская пара планирует вступление в протокол ЭКО и проведение преимплантационного генетического тестирования эмбрионов в криопротоколе. Анамнез отягощен, учитывая рождение больного ребенка от первого брака, смерть которого наступила в возрасте 1 года. Однако данные о погибшем ребенке (выписки из истории болезни, проведенные обследования, протокол вскрытия) отсутствуют. Родословная:

Объективный статус
Объективный статус

Результаты обследования

Спермиологическое исследование (обследование супруга)

Все значения в пределах референсных интервалов

УЗИ органов малого таза (обследование супруги)

Пороков развития органов малого таза не обнаружено

Анализ крови для определения группы крови и резус-фактора обоим супругам

У супруги: группа крови I (0), Rh- У супруга: группа крови I (0), Rh-

ЭКГ и ЭХО-КГ обоим супругам

Патологии не выявлено

Результаты обследования

Определение числа копий 7 и 8 экзонов в генах SMN1 и SMN2 методом MLPA

Обнаружена 1 копия экзона 7 гена _SMN1_ и 2 копии _SMN2_

Вопросы по задаче

План обследования

Для установления причины бесплодия у супружеской пары и выбора метода вспомогательных репродуктивных технологий необходимыми методами обследования являются

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • УЗИ органов малого таза (обследование супруги)
  • анализ крови для определения группы крови и резус-фактора обоим супругам
  • спермиологическое исследование (обследование супруга)

Обоснование

УЗИ проводится с целью исключения возможных пороков органов репродуктивной системы Порядок использования вспомогательных репродуктивных технологий, противопоказания и ограничения к их применению. Приложение №1 к приказу Министерства здравоохранения РФ от 30 августа 2012г. №107н https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70218364/

Причиной невынашивания может быть несовместимость по группе крови АВО и резус-фактору Порядок использования вспомогательных репродуктивных технологий, противопоказания и ограничения к их применению. Приложение №1 к приказу Министерства здравоохранения РФ от 30 августа 2012г. №107н https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70218364/

Спермиологическое исследование проводится с целью исключения мужского фактора бесплодия Порядок использования вспомогательных репродуктивных технологий, противопоказания и ограничения к их применению. Приложение №1 к приказу Министерства здравоохранения РФ от 30 августа 2012г. №107н https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70218364/

Алгоритм молекулярно-генетического обследования (диагноза)

Болезнь Верднига-Гоффмана наследуется по +_____________________________________+ типу наследования

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • аутосомно-рецессивному

Обоснование

Согласно базе данных OMIM, спинальная мышечная атрофия I-IV типа (в т.ч. болезнь Верднига-Гоффмана) наследуется аутосомно-рецессивно (OMIM:* https://omim.org/entry/253300[253300])

Алгоритм молекулярно-генетического обследования (диагноза)

Причиной развития болезни Верднига-Гоффмана является мутация в гене

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • _SMN1_

Обоснование

Комментарий: Спинальная мышечная атрофия типа I (СМА1) развивается вследствие точковой мутации или делеции 7-8 экзона гена _SMN1_ (OMIM:* https://omim.org/entry/600354[600354]) в гомозиготном или компаунд-гетерозиготном состоянии. Генетика. Учебник для вузов/Под. ред. академ. РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ «Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил. (Глава 21. Моногенные болезни человека. Раздел 21.5.2.3 Проксимальная спинальная амиотрофия, стр. 458 - 462) Открытая база данных OMIM: https://omim.org/entry/600354

Алгоритм молекулярно-генетического обследования (диагноза)

Мажорной мутацией при спинальной мышечной атрофии типа I (СМА I, болезнь Верднига-Гоффмана) является

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • делеция 7 и/или 8 экзона гена _SMN1_ в гомозиготном состоянии

Обоснование

Комментарий: Более 95% больных с 1-3 вариантами САМ имеют делецию 7 и/или 8 экзона теломерной копии SMN-гена в гомозиготном состоянии (гена выживаемости мотонейронов) Генетика. Учебник для вузов/Под. ред. академ. РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ «Академкнига», 2006, 2007 - 639 с.:ил. (Глава 21. Моногенные болезни человека. Раздел 21.5.2.3 Проксимальная спинальная амиотрофия, стр. 458 - 462)

Алгоритм молекулярно-генетического обследования (диагноза)

Частота гетерозиготного носительства мутации в гене _SMN1_ составляет 1 на +________+ человек

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • 40-50

Обоснование

Показатели частоты в различных популяциях варьируют от 1:6000 на 1:10000 новорожденных, что позволяет рассчитать, что гетерозиготным носителем мутации в гене _SMNt_ является каждый 40-50 чел. У жителей Московского региона частота носительства делеций гена _SMNt_ составляет 1:36 чел. (2,8%) Забненкова В.В., Щагина О.А., Поляков А.В. Результаты анализа носительства спинальной мышечной атрофии с использованием новой медицинской технологии «Количественный метод детекции числа копий генов локуса СМА».Медицинская генетика. 2016;15(2):18-23. https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-2-18-23 V.V. Zabnenkova, E.L. Dadali, M.G. Spiridonova, R.A. Zinchenko, A.V. Polyakov, 2012, published in Genetika, 2012, Vol. 48, No. 8, pp. 983–992.

Профилактика (медико-генетическое консультирование)

С целью поиска носительства супругом мутации в гене, ответственном за спинальную мышечную атрофию типа I, необходимо назначить

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • определение числа копий 7 и 8 экзонов в генах _SMN1_ и _SMN2_ методом MLPA

Обоснование

Метод MLPA для определения числа копий генов локуса СМА обеспечивает 100% точность диагностики при определении количества копий генов на геном. Однако 0,1% носителей в популяции имеют обе копии гена _SMNt_ на одной хромосоме (в цис-положении) и их генотип трактуют как генотип скрытого носителя. Таким образом, информативность данного метода не достигает 100%. Другого более точного метода для оценки числа копий генов локуса СМА в настоящий момент не существует. Забненкова В.В., Щагина О.А., Поляков А.В. Результаты анализа носительства спинальной мышечной атрофии с использованием новой медицинской технологии «Количественный метод детекции числа копий генов локуса СМА». Медицинская генетика. 2016;15(2):18-23. https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-2-18-23 (OMIM:* https://omim.org/entry/253300[253300]) https://omim.org/entry/253300

Профилактика (медико-генетическое консультирование)

С целью исключения риска рождения больного СМА1 ребёнка в данном браке обследовать супругу

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • необходимо методом MLPA на наличие числа копий 7 и 8 экзонов в генах _SMN1_ и _SMN2_

Обоснование

Метод MLPA для определения числа копий генов локуса СМА обеспечивает 100% точность диагностики при определении количества копий генов на геном. Однако 0,1% носителей в популяции имеют обе копии гена _SMNt_ на одной хромосоме (в цис-положении) и их генотип трактуют как генотип скрытого носителя. Таким образом, информативность данного метода не достигает 100%. Другого более точного метода для оценки числа копий генов локуса СМА в настоящий момент не существует. Забненкова В.В., Щагина О.А., Поляков А.В. Результаты анализа носительства спинальной мышечной атрофии с использованием новой медицинской технологии «Количественный метод детекции числа копий генов локуса СМА». Медицинская генетика. 2016;15(2):18-23. https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-2-18-23 (OMIM:* https://omim.org/entry/253300[253300]) https://omim.org/entry/253300

Профилактика (медико-генетическое консультирование)

Риск рождения больного СМА1 ребенка в обследованной семье, учитывая, что у супруги в результате проведения молекулярно-генетической диагностики обнаружены 2 копии экзона 7 гена _SMN1_ и одна копия гена _SMN2_, можно оценить как

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • низкий

Обоснование

Комментарий: Тип наследования СМА 1 является аутосомно-рецессивным, который характеризуется 25% риском рождения больного ребёнка в случае носительства мутации в гене обоими родителями. В нашем случае у супруги носительство мутации в гене _SMNt_ (_SMN1_) не обнаружено. Известно, что 0,1% носителей в популяции имеют обе копии гена _SMNt_ на одной хромосоме (в цис-положении) и их генотип трактуют как генотип скрытого носителя. Однако даже с учётом этого риск будет составлять не более 0,025% (0,1%х1/4=0,025%), что трактуется как низкий. (OMIM:* https://omim.org/entry/253300[253300]) https://omim.org/entry/253300 Генетика. Учебник для вузов/Под. ред. академ. РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ «Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил., стр. 453 – 455 Забненкова В.В., Щагина О.А., Поляков А.В. Результаты анализа носительства спинальной мышечной атрофии с использованием новой медицинской технологии «Количественный метод детекции числа копий генов локуса СМА».Медицинская генетика. 2016;15(2):18-23. https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-2-18-23

Профилактика (медико-генетическое консультирование)

При использовании вспомогательных репродуктивных технологий (экстракорпорального оплодотворения) для преодоления проблемы бесплодия в качестве профилактических мероприятий с целью повышения эффективности программы ЭКО и предотвращения рождения больного ребёнка в обследованной семье может быть рекомендовано проведение

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • преимплантационного генетического тестирования эмбрионов на анеуплоидии (ЭКО с ПГТ-А)

Обоснование

Комментарий 1: Показания для проведения предимплантационной диагностики: * Возраст женщины старше 34 лет * Возраст мужчины старше 39 лет * Носительство хромосомных перестроек, транслокаций, инверсий и других хромосомных и генетических патологий * Привычное невынашивание беременности (более 2 выкидышей) * Неудачные попытки ЭКО в анамнезе (более двух) Учебник для среднего профессионального образования коллектив авторов Акуленко Л.В., Угаров И.В. http://topuch.ru/uchebnik-dlya-srednego-professionalenogo-obrazovaniya-kollekti/index.html Комментарий 2: Повышен возрастной риск рождения больного ребенка с хромосомной патологией. 3+a| Трисомии 13, 18, 21 a| a| Возраст матери, годы a| Риск, % .7+a| Суммарный популяционный риск в зависимости от возраста матери a| < 19 a| 0,08 a| 20-24 a| 0,06 a| 25-29 a| 0,1 a| 30-34 a| 0,2 a| 35-39 a| 0,54 a| 40-44 a| 1,6 a| >45 a| 4,2 3+a| *Трисомия 21 (синдром Дауна)* a| 2+^a| Повторный риск для сибсов пробанда в зависимости от возраста матери a| a| Возраст матери, годы a| Риск, % a| Простая трисомная форма a| До 35 Свыше 35 a| 1 Удвоенный риск для данной возрастной группы {nbsp} Бочков, Н.П. Наследственные болезни/ Н.П. Бочков, Е.К. Гинтер, В.П. Пузырев. - М.:ГЭОТАР Медиа, 2012. - с.792 https://library.mededtech.ru/rest/documents/ISBN9785970422311/?anchor=paragraph_po1eav#paragraph_po1eav[(1)] {nbsp} Схема нарушения расхождения хромосом во 2-м делении мейоза и морфология ооцита в зависимости от возраста женщины. Gardner RJM, Sutherland GR. Chromosome Abnormalities and Genetic Counselling. Oxford University Press. 2011; 4: р.40

Диагноз

В результате проведения ЭКО с ПГТ-А был получен и протестирован один эмбрион - Т1: seq(13)x3,(X)x2, запись которого можно интерпретировать как

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • трисомия хромосомы 13

Обоснование

Согласно номенклатуре ISCN 2016 ISCN (2016): An International System for Human Cytogenetic Nomenclature, Reprint of: Cytogenetic and Genome Research 2016

Диагноз

Эмбрион, соответствующий протестированному образцу Т1, к переносу

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • не рекомендован

Обоснование

Комментарий: Согласно полученным результатам ПГТ-А (Т1: seq(13)x3,(X)x2) молекулярный кариотип эмбриона, соответствующего образцу Т1, с высокой степенью вероятности является анеуплоидным – характеризуется наличием полной формы трисомии хромосомы 13, что соответствует синдрому Патау. Эмбрионы с синдромом Патау частично жизнеспособны. Частота рождения детей с этим синдромом не превышает 1:6000. Продолжительность жизни таких детей в среднем составляет 1 год, вследствие наличия различнх пороков развития внутренних органов. Дети, достигающие более старшего возраста, имеют выраженную степень умственной отсталости. Генетика. Учебник для вузов/Под. ред. академ. РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ «Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил. (Глава 20, Хромосомные аномалии и обусловленные ими синдромы. Раздел 20.2.1.3 Трисомия по 13 хромосоме или синдром Патау, стр. 422) Комментарий: Согласно номенклатуре ISCN 2016 ISCN (2016): An International System for Human Cytogenetic Nomenclature, Reprint of: Cytogenetic and Genome Research 2016

Диагноз

Трисомия по хромосоме 13 фенотипически проявляется синдромом

Отметьте все подходящие варианты.

Показать правильный ответ

Правильный ответ:

  • Патау

Обоснование

Минимальные диагностические признаки трисомия 13 хромосомы; микроцефалия, полидактилия, расщелина губы и неба. Козлова С.И., Демикова Н.С. Наследственные синдромы и медико-генетическое консультирование: Атлас-справочник. 3-е изд., перераб. и дополн. М.:Т-во научных изданий КМК; Авторская академия.2007. 448 с., 236 ил. - с.286

Тренажёр для самостоятельной подготовки. Прохождение тестов не заменяет официальную аккредитацию и не начисляет ЗЕТ НМО.

Оставьте Ваш номер для консультации