Прочитайте условие и отметьте все подходящие варианты в каждом вопросе.
Мои материалы
Избранное, ошибки и результаты доступны только в этом браузере.
Избранное
Повторить ошибки
Мои результаты
Условие задачи
УСЛОВИЕ СИТУАЦИОННОЙ ЗАДАЧИ
Ситуация
В медико-генетическую консультацию обратилась семья с ребенком 4 лет для уточнения диагноза и прогноза потомства.
Жалобы
На отставание в росте, умственном развитии.
Анамнез заболевания
С рождения у ребенка пупочная и паховая грыжи, двусторонний крипторхизм. Раннее развитие с задержкой.
Анамнез жизни
Пробанд – мальчик, от 2 беременности (1 беременность от другого мужа закончилась выкидышем в раннем сроке), настоящая беременность протекала с угрозой прерывания в ІІІ триместре. Возраст матери на момент рождения ребенка 25 лет, отца – 28 лет, родители здоровы, брак неродственный. Роды 1, в 38 недель путем кесарева сечения. Ребенок родился в асфиксии, вес при рождении – 3860 г, рост – 52 см, окружность головы – 35 см. Выписан домой под наблюдение педиатра, невролога. При рождении ребенку ставился диагноз гипоксически-ишемического поражения ЦНС. Находился на естественном вскармливании до 1 месяца. В 2 месяца ребенок осмотрен врачом-неврологом по месту жительства и направлен к генетику.
При первичном осмотре генетиком в возрасте 2 месяцев отмечалось правильное телосложение, рост 55 см (10-25 перцентиль), вес 5000 г (25-50 перцентиль), субэктеричность кожных покровов, с мраморным рисунком, цианоз носогубного треугольника, пастозность лица, отечность век, пастозность кистей и стоп. Лицевые дизморфии включали крупные черты лица, длинные ресницы, гипертелоризм глаз, эпикант. Обращали на себя внимание гемангиомы на волосистой части головы, в области затылка. У ребенка имеются пупочная и паховые грыжи, микропенис, крипторхизм. По данным нейросонографии – признаки гипоксии мозга. Диагноз не установлен. Наблюдение в динамике.
Объективный статус
Консультация в возрасте 1 год 3 месяца. При осмотре: рост 78 см (25-50 перцентиль), вес 11 кг (50-75 перцентиль). Телосложение пропорциональное. Отмечаются следующие особенности: длинные глазные щели, длинные ресницы, гипертелоризм, эпикант, арковидные брови с разреженной латеральной частью, приплюснутый кончик носа, оттопыренные ушные раковины чашеобразной формы, выступающая нижняя губа, открытый рот (фото. 1), расщелина язычка, а также выявлена миопия средней степени и сходящееся косоглазие. Пальцы рук короткие, отмечаются конусообразная форма подущечек на пальцах рук (фетальные подушечки), плоскостопие. Ребенок прооперирован по поводу паховых грыж и крипторхизма. Одно яичко удалено, микропенис. Ребенок отстаёт в психо-речевом развитии, выявлено снижение слуха.
Объективный статус
Результаты обследования
Проведение ЭХО кардиографии
Пороков развития сердца не выявлено
Проведение УЗИ органов брюшной полости и почек
Патологии не обнаружено
Проведение ЭКГ исследования
Нормальный синусовый ритм. Нормальное положение электрической оси сердца.
Результаты лабораторных методов обследования
Цитогенетическое исследование
Кариотип – 46,XY (нормальный мужской)
Хромосомный микроматричный анализ
Исследование не проводилось (родители отказались, так как исследование платное)
Результаты обследования
Молекулярно-генетическое исследование (полноэкзомное секвенирование методом NGS)
В результате проведенного исследования выявлена описанная ранее мутация 13580A-T в гене _KMT2D_ в гетерозиготном состоянии.
Результаты обследования
Поиск выявленной мутации в гене KMT2D у родителей пробанда методом секвенирования по Сенгеру
У родителей мутация не выявлена
Вопросы по задаче
План обследования
Показать правильный ответ
Правильный ответ:
проведение ЭХО кардиографии
проведение УЗИ органов брюшной полости и почек
Обоснование
Для исключения врожденных пороков развития сердца
Gene Review
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK62111/[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK62111/]
Для исключения врожденных пороков развития внутренних органов
Gene Review
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK62111/[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK62111/]
План обследования
Показать правильный ответ
Правильный ответ:
цитогенетическое исследование
хромосомный микроматричный анализ
Обоснование
Анализ кариотипа показан в связи с отставанием в психомоторном развитии, внешними фенотипическими особенностями, отставанием в росте.
Наследственные болезни: национальное руководство / под редакцией Н.П. Бочкова, Е.К. Гинтера, В.П. Пузырева. – ГЭОТАР-Медиа. 2013. С. 453.
При отставании в развитии, росте, наличии микроаномалий развития и нормальном кариотипе может быть рекомендовано исследование на наличие хромосомного дисбаланса методом хромосомного микроматричного анализа.
Комментарий: Хромосомный микроматричный анализ (array-CGH, array-based Comparative Genome Hybridization) – современный молекулярно-цитогенетический метод, основанный на конкурентной гибридизации двух геномных ДНК-библиотек (одной, полученной из лимфоцитов периферической крови пациента с предполагаемым хромосомным нарушением, второй – контрольного образца от здорового индивида с нормальным кариотипом) на микроматрицах, представленных большим числом олигонуклеотидных ДНК-проб, с высокой плотностью покрывающих весь геном. В случае наличия хромосомного дисбаланса в кариотипе пациента (делеции или дупликации) соответствующий регион хромосомы будет выявлен за счет изменения в нем соотношения интенсивностей флуоресценции анализируемой и контрольной ДНК-библиотек. В зависимости от плотности используемых ДНК-микрочипов с помощью данного метода можно диагностировать хромосомные микроделеции и микродупликации, протяженностью от нескольких десятков тысяч пар нуклеотидов, невидимые при стандартном кариотипировании.
Наследственные болезни: национальное руководство / под ред. акад. РАМН Н.П. Бочкова, акад. РАМН Е.К. Гинтера, акад. РАМН В.П. Пузырева. — М. : ГЭОТАР-Медиа, 2012. — 936 с. Глава 17. c. 470-477. ISBN 978-5-9704-2231-1
Диагноз
Показать правильный ответ
Правильный ответ:
моногенных дизморфологических синдромов
Обоснование
Сочетание задержки психомоторного развития, роста и наличия специфических внешних особенностей (малые аномалии черепно-лицевой области) при нормальном кариотипе
Диагноз
Показать правильный ответ
Правильный ответ:
синдром Кабуки
Обоснование
Наличие характерных для этого синдрома фенотипических проявлений в виде специфических внешних черепно-лицевых особенностей, необычной формы подушечек пальцев, отставания в психо-речевом развитии.
молекулярно-генетическое исследование (полноэкзомное секвенирование методом NGS)
Обоснование
Наиболее целесообразно проведение полноэкзомного секвенирования методом NGS, так как:
1) имеется подозрение на один из генетически детерминированных дизморфологических синдромов – синдром Кабуки.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK62111/
2) существует два генетических варианта синдрома Кабуки. Гены, мутации в которых приводят к развитию синдрома протяжённые – содержат 56 экзонов и 32 экзона.
3) в ряде случаев имеется перекрывание фенотипов с иными генетически гетерогенными синдромами.
Для дифференциальной диагностики генетически гетерогенных заболеваний наиболее целесообразно проводить поиск мутаций во всех генах, ответственных за их возникновение, одновременно.
Гены, мутации в которых приводят к развитию синдрома Кабуки, протяжённые – содержат 56 экзонов и 32 экзона. В связи с чем наиболее целесообразно проведение полноэкзомного секвенирования методом NGS
необходимо провести поиск выявленной мутации в гене _KMT2D_ у родителей пробанда методом секвенирования по Сенгеру
Обоснование
Подтверждение либо унаследованного варианта мутации, либо мутации de novo
Обследование родителей на наличие выявленной мутации необходимо для оценки роли выявленной нуклеотидной замены в этиологии заболевания ребёнка, а также для оценки повторного риска рождения больного ребёнка в семье.
Комментарий: Обязательно проведение подтверждения результатов анализа NGS с помощью ортогональных методов для всех вариантов сиквенса, классифицированных как патогенные, вероятно патогенные и неопределенного значения для Менделевских заболеваний. Методы могут включать, но не ограничены: секвенирование таргетной области ДНК по Сенгеру, рестрикционный анализ, MLPAанализ, тестирование членов семьи пациента
О.П. Рыжкова, А.В. Поляков, М.Ю. Скоблов и др.
Рекомендации для интерпретации данных, полученных методом Next Generation Sequencing (NGS), 2016 г., стр.22
http://ngs.med-gen.ru/mgngs16/results/%D0%A0%D0%B5%D0%BA%D0%BE%D0%BC%D0%B5%D0%BD%D0%B4%D0%B0%D1%86%D0%B8%D0%B8%20%D0%B4%D0%BB%D1%8F%20%D0%B8%D0%BD%D1%82%D0%B5%D1%80%D0%BF%D1%80%D0%B5%D1%82%D0%B0%D1%86%D0%B8%D0%B8%20NGS%20%D0%B4%D0%B0%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D1%85.pdf
Комментарий: Проведение дополнительных анализов, таких как секвенирование по Сэнгеру для верификации выявленных вариантов, анализ ДНК родителей для установления цис-, транс-положения выявленных вариантов, вариантов de novo, родства и др.
Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б. и др.
Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2), стр. 15
Клинико-генеалогические данные и молекулярно-генетическое подтверждение диагноза
Gene Review
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK62111/[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK62111/]
Оценка риска при аутосомно-доминантном наследовании в случае новой мутации
Описанный случай является спорадическим, т.е. возникшим вследствие мутации de novo. Однако следует учитывать явление гонадного мозаицизма – отсутствие мутации в лимфоцитах периферической крови у здорового индивидуума при наличии этой мутации в одном или нескольких клонах половых клеток.
Наследственные болезни: национальное руководство / под ред. акад. РАМН Н.П. Бочкова, акад. РАМН Е.К. Гинтера, акад. РАМН В.П.Пузырева. – М.:ГЭОТАР-Медиа. 2012.-936 с., с.564